A narrativa acompanha a jornada de Anna através da solidão e das lutas pela autoestima, culminando na revelação de que Marnie é o espírito da sua avó, guiando-a para o perdão e a aceitação de segredos familiares geracionais. Temas tradicionais de alienação, memória, cura e amor familiar ancoram a história na narrativa emocional clássica do Studio Ghibli, sem que nenhuma mensagem de justiça social ou política de identidade se intrometa na premissa. O filme mantém um elenco de vozes e um cenário totalmente japoneses que se mantêm fiéis ao romance de Joan G.

Robinson de 1967 e às tradições artísticas de Ghibli, evitando quaisquer trocas de raça ou género. A intenção do criador foca-se em oferecer esperança a crianças isoladas, em vez de avançar pontos ideológicos. Embora algumas discussões de fãs especulem sobre subtexto queer na amizade das raparigas, a trama estabelece explicitamente Marnie como a avó de Anna, tornando tais leituras sem suporte pela história ou pelas escolhas de produção.