Halo (Violet Harper), un personaje original de la serie, dedica un tiempo de pantalla considerable a explorar y declarar una identidad no binaria con pronombres elle/elles mientras se reconecta con la fe musulmana y el hijab de su cuerpo anfitrión Gabrielle Daou; esto se cruza con un arco de relación del mismo sexo que involucra a Harper Row. El arco de Atlantis presenta prominentemente a Lagoon Boy en un trío poliamoroso con Coral y Rodunn, junto a la relación bisexual establecida de Kaldur'ahm con Wyynde.

Estos no son detalles de fondo, sino subtramas focales a lo largo de episodios dedicados. Los creadores Greg Weisman y Brandon Vietti han declarado repetidamente en entrevistas que la diversidad y la representación queer son prioridades deliberadas para reflejar 'el mundo que nos rodea', y Weisman ha desestimado públicamente las críticas amenazando sarcásticamente con eliminar el 'contenido de hombres blancos heterosexuales'.

La estructura de arcos enfocados de la temporada amplifica estos elementos junto con las tramas tradicionales de superhéroes, haciendo de la política de identidad un motor recurrente en lugar de un sabor incidental. La reacción del público en las redes sociales se dirigió al 'contenido LGBTQ+' como innecesario, lo que los showrunners abordaron y rechazaron directamente.