La temporada presenta a Wade 'Unique' Adams, el primer personaje transgénero del programa (nacido hombre, identificándose y actuando como mujer), cuyo arco se centra en la presentación de género, la actuación como Unique, y el aliento de Kurt y Mercedes en episodios como 'Saturday Night Glee-ver' y 'Nationals'. Esta representación sirve como un punto focal en lugar de una diversidad incidental.

El episodio 'I Kissed a Girl' dedica un tiempo considerable a la salida del armario de Santana Lopez como lesbiana, incluyendo el apoyo del club a través de actuaciones de 'música de chicas', su abuela desheredándola, y temas de homofobia y aceptación. Los arcos continuos de Kurt y Blaine avanzan en su relación física, mientras que los dos papás de Rachel y la campaña al congreso de Sue Sylvester incorporan ataques políticos basados en la identidad.