El elenco principal incluye al protagonista masculino Rintaro Okabe y a los personajes femeninos Kurisu Makise y Mayuri Shiina, con rutas de romance heterosexual que impulsan las apuestas emocionales en múltiples finales. Ruka Urushibara aparece como un chico que se viste de forma femenina y se convierte en mujer en una línea temporal a través de D-Mail, sirviendo como un dispositivo de trama de viaje en el tiempo en lugar de una exploración de identidad.

No existen creación de personajes, selección de pronombres, citas agénero, ni declaraciones de los desarrolladores sobre DEI, activismo o mandatos de representación en el lanzamiento de 2009/2016. Las búsquedas confirman que no hubo participación de consultores ni reescrituras narrativas para comentarios sociales. El elemento Ruka se superpone con temas modernos pero funciona como un tropo clásico de ciencia ficción sin ser central para la premisa o los temas.