La historia sigue al protagonista masculino Solid Snake, un operativo de FOXHOUND encargado de infiltrarse en bases enemigas para neutralizar las armas Metal Gear y enfrentarse a Big Boss. Los temas centrales giran en torno a la lealtad del soldado, los mercenarios apátridas y el espionaje clásico sin ninguna superposición de mensajes sociales contemporáneos.

La ausencia de personalización de personajes, sistemas de romance o elementos LGBTQ+ mantiene el enfoque completamente en la jugabilidad táctica y la tensión narrativa de los originales de las décadas de 1980 y 1990. La reedición de 2023 mantiene estas bases con imágenes de pixel-art inalteradas que muestran al protagonista masculino, guardias y elementos de interfaz estándar como los medidores LIFE y CLASS. No aparecen selectores de pronombres, opciones de tipo de cuerpo ni características de identidad en la interfaz o las mecánicas.

Las notas del desarrollador y los detalles de los parches enfatizan la fidelidad al material original a través de solo ajustes menores de jugabilidad, sin reescrituras narrativas ni requisitos de representación adicionales. Este enfoque confirma la completa evitación del título de contenido ideológico progresista en el casting, los temas y las decisiones de producción.