Los elementos progresistas aparecen en el sistema de romance y en subtramas selectas en lugar de impulsar la premisa. Conquest incluye una opción de matrimonio entre personas del mismo sexo donde un avatar masculino puede alcanzar un rango S de apoyo y casarse con el personaje masculino Niles, y tanto Niles como el personaje paralelo Rhajat son retratados como bisexuales; estas relaciones funcionan mecánicamente como las de sexo opuesto para bonificaciones de estadísticas, pero no producen hijos. Subtramas adicionales involucran a Soleil, cuya atracción por las mujeres presenta una escena en la versión japonesa con un polvo mágico que altera las percepciones, que Nintendo alteró en la localización occidental para eliminar implicaciones de agresión sexual o terapia de conversión, y a Forrest (hijo de Leo), cuya vestimenta y presentación femenina conducen a un arco de aceptación padre-hijo.

Nintendo declaró públicamente que las inclusiones tenían como objetivo reflejar la diversidad de la comunidad, al tiempo que realizaba cambios de localización para la adecuación occidental. Estos elementos crean una representación y normalización notables de LGBTQ+ en arcos de personajes y apoyos, pero siguen siendo secundarios a los temas centrales de guerra, traición y lazos fraternales. No existe evidencia de firmas consultoras, personalización de pronombres o encuadre de política de identidad como base de la historia. La recepción mostró altas puntuaciones de críticos y usuarios con controversia limitada centrada en la escena de Soleil en lugar de una reacción ideológica generalizada.